Ich habe ein Backup vom Verzeichnis var.
In var/lib/mysql liegen ja die datenbanken in den entsprechenden verzeichnissen wie mysql, dbispconfig usw.
Auch meine angelegten Datenbanken. Diese habe ich im Vorfeld mit ispconfig genauso angelegt wie auf dem alten Server. Dann die Datenbankfiles wie Du schon vermutest kopiert. Rechte und Besitzer identisch.
Es gibt immer noch einzelne Ordner.
Habe da datenbank123, dbispconfig, mysql, performance_schema, phpmyadmin, roundcube.
In allen sind .frm .ibd files.
Bei der Fehlersuch stieß ich auf das:
In praktisch allen Fällen ist MariaDB ein 1:1-Ersatz derselben MySQL-Version
mariadb.com
Kann aber nicht sagen ob es vielleicht damit zusammenhängt.
Email war noch uralte nicht mehr aktive drin. Sorry, habe sie aktualisiert.