Ein Upgrade auf eine neue Distributionsversion (also z.b. 8.04 auf 8.10) solltest Du mit diesen Befehlen ausführen:
apt-get update
apt-get dist-upgrade
danach solltest Du alle Dienste überprüfen und ggf. nochmal das perfect setup durchgehen, falls etwas nicht geht, da sich zwischen den Verionen immer mal die syntax der Konfigurationsdateien ändern kann.