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Verwendet deine Webseite eine Session?
Also, kann man sich da irgendwie einloggen oder so?
Wenn ja solltest du da nix deaktivieren, denn genau hier werden die Daten zu laufenden Sessions gespeichert.
PHP löscht die Dateien von Zeit zu Zeit. Da der Server ja nicht weiß, wann eine Seite verlassen worden ist (http ist ein statusloses Protokoll). Ich glaube das kann man auch irgendwo in der php.ini konfigurieren.