Ja das kann man. Du kannst die Dienste nach belieben auf die Server verteilen. Die Installation erfolgt im expert Modus und ist im Handbuch beschrieben.
Alternativ kannst Du Dir diese Installationsanleitung anschauen.
Das Prinzip ist immer das gleiche, du installierst nur die benötigten Dienste auf dem jeweiligen Server, mysql muss auf allen Servern sein. Das funktioniert auch unter Squeeze, bzw Centos etc... HowtoForge Linux Tutorials » Multiserver Installation eines Debian 5.0 Server mit ISPConfig 3