Das kann verschiedene Ursachen haben. Z.B. kann Linux keine User löschen während sie eingeloggt sind, der User ist also weiterhin da obwohl ISPConfig ihn korrekt mit userdel gelöscht hat. Oder Du hast nicht abgewartet bis die Löschung ausgeführt worden ist. Ob ein Job bearietet wurde steht in der jobqueue im Monitor.
Mit userdel. Habe aber gesehen dass ispconfig zwar userdel -f für normale shell user nimmt, das -f aber nicht für jailkit User verwendet wird. habe das jetzt mel geändert.