Öffne die Datei /etc/init.d/ispconfig_server in einem Editor und kommentiere die Zeile:
/root/ispconfig/php/php -q /root/ispconfig/scripts/shell/firewall.php
aus, also z.B. durch Voranstellen einer Raute:
# /root/ispconfig/php/php -q /root/ispconfig/scripts/shell/firewall.php