Vermutlich hast du * und ip bei deinen seiten gemischt, das geht aber beim apache nicht da eine ip eine höhere priorität als eine wildcrd hat. Du musst also entweder alle seiten auf * oder alle seiten auf die ip ändern.
Viele Alternativen gibt es dann aber nicht, die einzig andere ist dass die weiteren Webseiten nicht in der apache Konfiguration existieren, also im /etc/apache/sites-enabled Verzeichnis unter Debian und Ubuntu.
möglicherweise hat das apache Update die Konfiguration geändert. Führe mal ein manuelles ispconfig update durch wie in den release notes beschrieben und lass die Dienste dabei rekonfigurieren.